Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a4bQ9ES61 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ms4a4bQ9ES61 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ms4a4bQ9ES61 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a4bQ9ES61 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms