Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lima1Q9ERG0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lima1Q9ERG0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lima1Q9ERG0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lima1Q9ERG0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lima1Q9ERG0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms