Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf8Q9EQH4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf8Q9EQH4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf8Q9EQH4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf8Q9EQH4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf8Q9EQH4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf8Q9EQH4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf8Q9EQH4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf8Q9EQH4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf8Q9EQH4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf8Q9EQH4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf8Q9EQH4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf8Q9EQH4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf8Q9EQH4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Taf8Q9EQH4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms