Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chst1Q9EQC0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chst1Q9EQC0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chst1Q9EQC0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chst1Q9EQC0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chst1Q9EQC0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chst1Q9EQC0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chst1Q9EQC0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chst1Q9EQC0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chst1Q9EQC0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chst1Q9EQC0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms