Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cxcr6Q9EQ16 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cxcr6Q9EQ16 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cxcr6Q9EQ16 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cxcr6Q9EQ16 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcr6Q9EQ16 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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