Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r63Q9EPT1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r63Q9EPT1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r63Q9EPT1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r63Q9EPT1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms