Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Clstn1Q9EPL2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clstn1Q9EPL2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clstn1Q9EPL2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clstn1Q9EPL2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clstn1Q9EPL2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clstn1Q9EPL2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Clstn1Q9EPL2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clstn1Q9EPL2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clstn1Q9EPL2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clstn1Q9EPL2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn1Q9EPL2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clstn1Q9EPL2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clstn1Q9EPL2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clstn1Q9EPL2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clstn1Q9EPL2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clstn1Q9EPL2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clstn1Q9EPL2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clstn1Q9EPL2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clstn1Q9EPL2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clstn1Q9EPL2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn1Q9EPL2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn1Q9EPL2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clstn1Q9EPL2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clstn1Q9EPL2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clstn1Q9EPL2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clstn1Q9EPL2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clstn1Q9EPL2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Clstn1Q9EPL2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Clstn1Q9EPL2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clstn1Q9EPL2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clstn1Q9EPL2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clstn1Q9EPL2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clstn1Q9EPL2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clstn1Q9EPL2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clstn1Q9EPL2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Clstn1Q9EPL2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clstn1Q9EPL2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Clstn1Q9EPL2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clstn1Q9EPL2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clstn1Q9EPL2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clstn1Q9EPL2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clstn1Q9EPL2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Clstn1Q9EPL2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clstn1Q9EPL2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Clstn1Q9EPL2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Clstn1Q9EPL2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clstn1Q9EPL2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clstn1Q9EPL2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clstn1Q9EPL2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clstn1Q9EPL2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clstn1Q9EPL2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clstn1Q9EPL2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clstn1Q9EPL2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clstn1Q9EPL2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clstn1Q9EPL2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clstn1Q9EPL2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clstn1Q9EPL2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clstn1Q9EPL2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms