Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnft1Q9DCN7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnft1Q9DCN7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnft1Q9DCN7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnft1Q9DCN7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnft1Q9DCN7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnft1Q9DCN7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnft1Q9DCN7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnft1Q9DCN7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnft1Q9DCN7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnft1Q9DCN7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnft1Q9DCN7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnft1Q9DCN7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnft1Q9DCN7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnft1Q9DCN7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnft1Q9DCN7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnft1Q9DCN7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnft1Q9DCN7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnft1Q9DCN7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnft1Q9DCN7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnft1Q9DCN7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnft1Q9DCN7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnft1Q9DCN7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnft1Q9DCN7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnft1Q9DCN7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnft1Q9DCN7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms