Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmpcaQ9DC61 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PmpcaQ9DC61 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PmpcaQ9DC61 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PmpcaQ9DC61 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PmpcaQ9DC61 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PmpcaQ9DC61 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms