Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc46a3Q9DC26 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc46a3Q9DC26 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc46a3Q9DC26 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc46a3Q9DC26 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc46a3Q9DC26 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc46a3Q9DC26 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc46a3Q9DC26 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc46a3Q9DC26 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc46a3Q9DC26 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc46a3Q9DC26 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc46a3Q9DC26 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc46a3Q9DC26 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc46a3Q9DC26 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc46a3Q9DC26 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc46a3Q9DC26 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc46a3Q9DC26 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc46a3Q9DC26 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc46a3Q9DC26 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc46a3Q9DC26 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms