Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Apbb2Q9DBR4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apbb2Q9DBR4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb2Q9DBR4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apbb2Q9DBR4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms