Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smim23Q9DAL0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smim23Q9DAL0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim23Q9DAL0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim23Q9DAL0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim23Q9DAL0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms