Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PacrgQ9DAK2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PacrgQ9DAK2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PacrgQ9DAK2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PacrgQ9DAK2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PacrgQ9DAK2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PacrgQ9DAK2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PacrgQ9DAK2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PacrgQ9DAK2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms