Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DAE8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DAE8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DAE8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DAE8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DAE8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DAE8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9DAE8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9DAE8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DAE8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9DAE8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9DAE8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9DAE8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9DAE8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9DAE8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9DAE8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9DAE8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9DAE8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9DAE8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9DAE8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9DAE8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9DAE8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9DAE8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9DAE8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9DAE8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DAE8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9DAE8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9DAE8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9DAE8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9DAE8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9DAE8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9DAE8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9DAE8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9DAE8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9DAE8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9DAE8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9DAE8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9DAE8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9DAE8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9DAE8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9DAE8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9DAE8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9DAE8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.9 ms