Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntd1Q9D995 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntd1Q9D995 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntd1Q9D995 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntd1Q9D995 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntd1Q9D995 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntd1Q9D995 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntd1Q9D995 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntd1Q9D995 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntd1Q9D995 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntd1Q9D995 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntd1Q9D995 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntd1Q9D995 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntd1Q9D995 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntd1Q9D995 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntd1Q9D995 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntd1Q9D995 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntd1Q9D995 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntd1Q9D995 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cntd1Q9D995 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cntd1Q9D995 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntd1Q9D995 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntd1Q9D995 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms