Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alkbh4Q9D8F1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Alkbh4Q9D8F1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh4Q9D8F1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh4Q9D8F1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh4Q9D8F1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh4Q9D8F1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alkbh4Q9D8F1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Alkbh4Q9D8F1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alkbh4Q9D8F1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Alkbh4Q9D8F1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Alkbh4Q9D8F1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Alkbh4Q9D8F1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alkbh4Q9D8F1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Alkbh4Q9D8F1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms