Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chmp4bQ9D8B3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chmp4bQ9D8B3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chmp4bQ9D8B3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chmp4bQ9D8B3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chmp4bQ9D8B3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chmp4bQ9D8B3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Chmp4bQ9D8B3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chmp4bQ9D8B3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chmp4bQ9D8B3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chmp4bQ9D8B3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp4bQ9D8B3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp4bQ9D8B3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp4bQ9D8B3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chmp4bQ9D8B3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Chmp4bQ9D8B3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chmp4bQ9D8B3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chmp4bQ9D8B3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp4bQ9D8B3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp4bQ9D8B3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp4bQ9D8B3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Chmp4bQ9D8B3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chmp4bQ9D8B3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chmp4bQ9D8B3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chmp4bQ9D8B3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chmp4bQ9D8B3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chmp4bQ9D8B3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Chmp4bQ9D8B3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chmp4bQ9D8B3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chmp4bQ9D8B3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chmp4bQ9D8B3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chmp4bQ9D8B3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chmp4bQ9D8B3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chmp4bQ9D8B3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chmp4bQ9D8B3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chmp4bQ9D8B3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chmp4bQ9D8B3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chmp4bQ9D8B3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp4bQ9D8B3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chmp4bQ9D8B3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chmp4bQ9D8B3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chmp4bQ9D8B3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chmp4bQ9D8B3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chmp4bQ9D8B3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chmp4bQ9D8B3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chmp4bQ9D8B3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms