Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dnajc4Q9D844 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnajc4Q9D844 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc4Q9D844 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc4Q9D844 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnajc4Q9D844 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms