Protein–RNA interactions for Protein: Q9D809

2200002D01Rik, MCG22941, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2200002D01RikQ9D809 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
2200002D01RikQ9D809 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
2200002D01RikQ9D809 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
2200002D01RikQ9D809 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
2200002D01RikQ9D809 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2200002D01RikQ9D809 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2200002D01RikQ9D809 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2200002D01RikQ9D809 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2200002D01RikQ9D809 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2200002D01RikQ9D809 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
2200002D01RikQ9D809 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms