Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tspan17Q9D7W4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tspan17Q9D7W4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tspan17Q9D7W4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tspan17Q9D7W4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan17Q9D7W4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms