Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf13Q9D777 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf13Q9D777 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf13Q9D777 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfsf13Q9D777 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfsf13Q9D777 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfsf13Q9D777 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms