Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6H2

Hspb11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb11Q9D6H2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hspb11Q9D6H2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hspb11Q9D6H2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hspb11Q9D6H2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hspb11Q9D6H2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hspb11Q9D6H2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hspb11Q9D6H2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hspb11Q9D6H2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hspb11Q9D6H2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hspb11Q9D6H2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms