Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930556J24RikQ9D4U7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930556J24RikQ9D4U7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930556J24RikQ9D4U7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930556J24RikQ9D4U7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms