Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4G9

Rmi1, RecQ-mediated genome instability protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi1Q9D4G9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rmi1Q9D4G9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rmi1Q9D4G9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rmi1Q9D4G9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rmi1Q9D4G9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rmi1Q9D4G9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rmi1Q9D4G9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rmi1Q9D4G9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rmi1Q9D4G9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rmi1Q9D4G9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rmi1Q9D4G9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rmi1Q9D4G9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rmi1Q9D4G9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rmi1Q9D4G9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rmi1Q9D4G9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms