Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sohlh2Q9D489 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sohlh2Q9D489 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sohlh2Q9D489 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sohlh2Q9D489 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sohlh2Q9D489 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sohlh2Q9D489 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sohlh2Q9D489 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sohlh2Q9D489 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sohlh2Q9D489 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sohlh2Q9D489 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sohlh2Q9D489 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sohlh2Q9D489 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sohlh2Q9D489 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sohlh2Q9D489 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sohlh2Q9D489 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sohlh2Q9D489 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sohlh2Q9D489 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sohlh2Q9D489 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sohlh2Q9D489 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sohlh2Q9D489 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sohlh2Q9D489 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sohlh2Q9D489 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sohlh2Q9D489 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sohlh2Q9D489 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms