Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpn3Q9D3W4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpn3Q9D3W4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpn3Q9D3W4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpn3Q9D3W4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpn3Q9D3W4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpn3Q9D3W4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpn3Q9D3W4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpn3Q9D3W4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpn3Q9D3W4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gpn3Q9D3W4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gpn3Q9D3W4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpn3Q9D3W4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gpn3Q9D3W4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpn3Q9D3W4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpn3Q9D3W4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpn3Q9D3W4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpn3Q9D3W4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms