Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bcas2Q9D287 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bcas2Q9D287 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bcas2Q9D287 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bcas2Q9D287 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bcas2Q9D287 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcas2Q9D287 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcas2Q9D287 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcas2Q9D287 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bcas2Q9D287 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms