Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SarnpQ9D1J3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SarnpQ9D1J3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SarnpQ9D1J3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SarnpQ9D1J3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SarnpQ9D1J3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms