Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H6

Ndufaf4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf4Q9D1H6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufaf4Q9D1H6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufaf4Q9D1H6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufaf4Q9D1H6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndufaf4Q9D1H6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf4Q9D1H6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf4Q9D1H6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf4Q9D1H6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf4Q9D1H6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf4Q9D1H6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf4Q9D1H6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndufaf4Q9D1H6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndufaf4Q9D1H6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndufaf4Q9D1H6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufaf4Q9D1H6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufaf4Q9D1H6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufaf4Q9D1H6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufaf4Q9D1H6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufaf4Q9D1H6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufaf4Q9D1H6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms