Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc167Q9D162 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc167Q9D162 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc167Q9D162 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc167Q9D162 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc167Q9D162 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms