Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyc1Q9D0M3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyc1Q9D0M3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyc1Q9D0M3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyc1Q9D0M3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyc1Q9D0M3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyc1Q9D0M3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyc1Q9D0M3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyc1Q9D0M3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms