Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F3

Lman1, Protein ERGIC-53, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lman1Q9D0F3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lman1Q9D0F3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lman1Q9D0F3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lman1Q9D0F3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lman1Q9D0F3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lman1Q9D0F3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lman1Q9D0F3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lman1Q9D0F3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lman1Q9D0F3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lman1Q9D0F3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lman1Q9D0F3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lman1Q9D0F3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lman1Q9D0F3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lman1Q9D0F3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lman1Q9D0F3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lman1Q9D0F3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lman1Q9D0F3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lman1Q9D0F3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lman1Q9D0F3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lman1Q9D0F3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lman1Q9D0F3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lman1Q9D0F3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lman1Q9D0F3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lman1Q9D0F3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lman1Q9D0F3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lman1Q9D0F3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lman1Q9D0F3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lman1Q9D0F3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lman1Q9D0F3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lman1Q9D0F3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lman1Q9D0F3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms