Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bud23Q9CY21 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bud23Q9CY21 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bud23Q9CY21 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bud23Q9CY21 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bud23Q9CY21 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bud23Q9CY21 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bud23Q9CY21 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bud23Q9CY21 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bud23Q9CY21 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bud23Q9CY21 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bud23Q9CY21 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bud23Q9CY21 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bud23Q9CY21 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bud23Q9CY21 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bud23Q9CY21 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bud23Q9CY21 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bud23Q9CY21 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bud23Q9CY21 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bud23Q9CY21 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bud23Q9CY21 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bud23Q9CY21 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bud23Q9CY21 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bud23Q9CY21 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bud23Q9CY21 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bud23Q9CY21 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bud23Q9CY21 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bud23Q9CY21 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bud23Q9CY21 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bud23Q9CY21 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bud23Q9CY21 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bud23Q9CY21 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms