Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem175Q9CXY1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem175Q9CXY1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem175Q9CXY1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem175Q9CXY1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem175Q9CXY1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem175Q9CXY1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem175Q9CXY1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem175Q9CXY1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem175Q9CXY1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem175Q9CXY1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem175Q9CXY1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem175Q9CXY1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem175Q9CXY1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem175Q9CXY1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms