Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH3

3300002I08Rik, RIKEN cDNA 3300002I08, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3300002I08RikQ9CXH3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
3300002I08RikQ9CXH3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
3300002I08RikQ9CXH3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
3300002I08RikQ9CXH3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
3300002I08RikQ9CXH3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
3300002I08RikQ9CXH3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
3300002I08RikQ9CXH3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
3300002I08RikQ9CXH3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
3300002I08RikQ9CXH3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
3300002I08RikQ9CXH3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
3300002I08RikQ9CXH3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
3300002I08RikQ9CXH3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
3300002I08RikQ9CXH3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
3300002I08RikQ9CXH3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
3300002I08RikQ9CXH3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
3300002I08RikQ9CXH3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
3300002I08RikQ9CXH3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
3300002I08RikQ9CXH3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
3300002I08RikQ9CXH3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
3300002I08RikQ9CXH3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms