Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NubplQ9CWD8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NubplQ9CWD8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NubplQ9CWD8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NubplQ9CWD8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NubplQ9CWD8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NubplQ9CWD8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NubplQ9CWD8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NubplQ9CWD8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NubplQ9CWD8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NubplQ9CWD8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NubplQ9CWD8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NubplQ9CWD8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NubplQ9CWD8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NubplQ9CWD8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NubplQ9CWD8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NubplQ9CWD8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NubplQ9CWD8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NubplQ9CWD8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NubplQ9CWD8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NubplQ9CWD8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NubplQ9CWD8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NubplQ9CWD8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NubplQ9CWD8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NubplQ9CWD8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NubplQ9CWD8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NubplQ9CWD8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NubplQ9CWD8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms