Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4931417E11RikQ9CR05 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4931417E11RikQ9CR05 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931417E11RikQ9CR05 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931417E11RikQ9CR05 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms