Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mri1Q9CQT1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mri1Q9CQT1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mri1Q9CQT1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mri1Q9CQT1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mri1Q9CQT1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mri1Q9CQT1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mri1Q9CQT1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mri1Q9CQT1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mri1Q9CQT1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mri1Q9CQT1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mri1Q9CQT1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mri1Q9CQT1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mri1Q9CQT1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mri1Q9CQT1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mri1Q9CQT1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mri1Q9CQT1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms