Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DenrQ9CQJ6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DenrQ9CQJ6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DenrQ9CQJ6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DenrQ9CQJ6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DenrQ9CQJ6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms