Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rpl39lQ9CQD0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rpl39lQ9CQD0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rpl39lQ9CQD0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rpl39lQ9CQD0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rpl39lQ9CQD0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rpl39lQ9CQD0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl39lQ9CQD0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rpl39lQ9CQD0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rpl39lQ9CQD0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl39lQ9CQD0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl39lQ9CQD0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rpl39lQ9CQD0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rpl39lQ9CQD0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rpl39lQ9CQD0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rpl39lQ9CQD0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rpl39lQ9CQD0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rpl39lQ9CQD0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rpl39lQ9CQD0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl39lQ9CQD0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl39lQ9CQD0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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