Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl49Q9CQ40 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mrpl49Q9CQ40 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl49Q9CQ40 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mrpl49Q9CQ40 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mrpl49Q9CQ40 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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