Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ3

Tomm22, Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm22Q9CPQ3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tomm22Q9CPQ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tomm22Q9CPQ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tomm22Q9CPQ3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tomm22Q9CPQ3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tomm22Q9CPQ3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tomm22Q9CPQ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tomm22Q9CPQ3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tomm22Q9CPQ3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tomm22Q9CPQ3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tomm22Q9CPQ3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tomm22Q9CPQ3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tomm22Q9CPQ3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tomm22Q9CPQ3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tomm22Q9CPQ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tomm22Q9CPQ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tomm22Q9CPQ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tomm22Q9CPQ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tomm22Q9CPQ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tomm22Q9CPQ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tomm22Q9CPQ3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tomm22Q9CPQ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Tomm22Q9CPQ3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tomm22Q9CPQ3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tomm22Q9CPQ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tomm22Q9CPQ3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tomm22Q9CPQ3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Tomm22Q9CPQ3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tomm22Q9CPQ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tomm22Q9CPQ3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tomm22Q9CPQ3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tomm22Q9CPQ3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tomm22Q9CPQ3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tomm22Q9CPQ3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tomm22Q9CPQ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tomm22Q9CPQ3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tomm22Q9CPQ3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tomm22Q9CPQ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tomm22Q9CPQ3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tomm22Q9CPQ3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tomm22Q9CPQ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tomm22Q9CPQ3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tomm22Q9CPQ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tomm22Q9CPQ3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tomm22Q9CPQ3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tomm22Q9CPQ3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tomm22Q9CPQ3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tomm22Q9CPQ3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tomm22Q9CPQ3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tomm22Q9CPQ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tomm22Q9CPQ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tomm22Q9CPQ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tomm22Q9CPQ3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tomm22Q9CPQ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms