Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Abcg5Q99PE8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcg5Q99PE8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Abcg5Q99PE8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Abcg5Q99PE8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg5Q99PE8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg5Q99PE8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg5Q99PE8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg5Q99PE8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcg5Q99PE8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Abcg5Q99PE8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcg5Q99PE8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcg5Q99PE8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg5Q99PE8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Abcg5Q99PE8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg5Q99PE8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcg5Q99PE8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg5Q99PE8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg5Q99PE8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcg5Q99PE8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg5Q99PE8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg5Q99PE8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg5Q99PE8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg5Q99PE8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg5Q99PE8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcg5Q99PE8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms