Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pcgf6Q99NA9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pcgf6Q99NA9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pcgf6Q99NA9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pcgf6Q99NA9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pcgf6Q99NA9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Pcgf6Q99NA9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Pcgf6Q99NA9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pcgf6Q99NA9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pcgf6Q99NA9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pcgf6Q99NA9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pcgf6Q99NA9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pcgf6Q99NA9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pcgf6Q99NA9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Pcgf6Q99NA9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pcgf6Q99NA9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pcgf6Q99NA9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Pcgf6Q99NA9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pcgf6Q99NA9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pcgf6Q99NA9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pcgf6Q99NA9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pcgf6Q99NA9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pcgf6Q99NA9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pcgf6Q99NA9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pcgf6Q99NA9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Pcgf6Q99NA9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Pcgf6Q99NA9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pcgf6Q99NA9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pcgf6Q99NA9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pcgf6Q99NA9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pcgf6Q99NA9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pcgf6Q99NA9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pcgf6Q99NA9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pcgf6Q99NA9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pcgf6Q99NA9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pcgf6Q99NA9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pcgf6Q99NA9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pcgf6Q99NA9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pcgf6Q99NA9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pcgf6Q99NA9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pcgf6Q99NA9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pcgf6Q99NA9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pcgf6Q99NA9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pcgf6Q99NA9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Pcgf6Q99NA9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pcgf6Q99NA9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pcgf6Q99NA9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pcgf6Q99NA9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pcgf6Q99NA9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pcgf6Q99NA9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pcgf6Q99NA9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Pcgf6Q99NA9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pcgf6Q99NA9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pcgf6Q99NA9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Pcgf6Q99NA9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.79■■■■□ 3
Pcgf6Q99NA9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Pcgf6Q99NA9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pcgf6Q99NA9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Pcgf6Q99NA9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Pcgf6Q99NA9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Pcgf6Q99NA9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pcgf6Q99NA9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms