Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpgs1Q99MS8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tpgs1Q99MS8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tpgs1Q99MS8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpgs1Q99MS8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpgs1Q99MS8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tpgs1Q99MS8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpgs1Q99MS8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpgs1Q99MS8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tpgs1Q99MS8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpgs1Q99MS8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tpgs1Q99MS8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpgs1Q99MS8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpgs1Q99MS8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpgs1Q99MS8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpgs1Q99MS8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpgs1Q99MS8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpgs1Q99MS8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpgs1Q99MS8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpgs1Q99MS8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpgs1Q99MS8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpgs1Q99MS8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpgs1Q99MS8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpgs1Q99MS8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpgs1Q99MS8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpgs1Q99MS8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpgs1Q99MS8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpgs1Q99MS8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpgs1Q99MS8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpgs1Q99MS8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpgs1Q99MS8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpgs1Q99MS8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpgs1Q99MS8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms