Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ2

Abtb1, Ankyrin repeat and BTB/POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abtb1Q99LJ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abtb1Q99LJ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abtb1Q99LJ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Abtb1Q99LJ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abtb1Q99LJ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abtb1Q99LJ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abtb1Q99LJ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abtb1Q99LJ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abtb1Q99LJ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abtb1Q99LJ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abtb1Q99LJ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Abtb1Q99LJ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abtb1Q99LJ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abtb1Q99LJ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abtb1Q99LJ2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abtb1Q99LJ2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abtb1Q99LJ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abtb1Q99LJ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abtb1Q99LJ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abtb1Q99LJ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abtb1Q99LJ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abtb1Q99LJ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abtb1Q99LJ2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abtb1Q99LJ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abtb1Q99LJ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abtb1Q99LJ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abtb1Q99LJ2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abtb1Q99LJ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abtb1Q99LJ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms