Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clint1Q99KN9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clint1Q99KN9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clint1Q99KN9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clint1Q99KN9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clint1Q99KN9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clint1Q99KN9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clint1Q99KN9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clint1Q99KN9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clint1Q99KN9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clint1Q99KN9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clint1Q99KN9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clint1Q99KN9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clint1Q99KN9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clint1Q99KN9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clint1Q99KN9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clint1Q99KN9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clint1Q99KN9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Clint1Q99KN9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms