Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ8

Dctn2, Dynactin subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn2Q99KJ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dctn2Q99KJ8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dctn2Q99KJ8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dctn2Q99KJ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dctn2Q99KJ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dctn2Q99KJ8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Dctn2Q99KJ8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Dctn2Q99KJ8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dctn2Q99KJ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dctn2Q99KJ8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dctn2Q99KJ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dctn2Q99KJ8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms