Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tspan1Q99J59 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tspan1Q99J59 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tspan1Q99J59 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tspan1Q99J59 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tspan1Q99J59 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan1Q99J59 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan1Q99J59 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan1Q99J59 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan1Q99J59 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan1Q99J59 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan1Q99J59 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan1Q99J59 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan1Q99J59 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan1Q99J59 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan1Q99J59 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan1Q99J59 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan1Q99J59 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan1Q99J59 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan1Q99J59 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan1Q99J59 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan1Q99J59 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan1Q99J59 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tspan1Q99J59 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tspan1Q99J59 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tspan1Q99J59 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan1Q99J59 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tspan1Q99J59 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tspan1Q99J59 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan1Q99J59 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan1Q99J59 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tspan1Q99J59 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tspan1Q99J59 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Tspan1Q99J59 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan1Q99J59 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tspan1Q99J59 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan1Q99J59 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan1Q99J59 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tspan1Q99J59 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan1Q99J59 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan1Q99J59 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tspan1Q99J59 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tspan1Q99J59 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan1Q99J59 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tspan1Q99J59 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tspan1Q99J59 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan1Q99J59 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan1Q99J59 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan1Q99J59 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan1Q99J59 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tspan1Q99J59 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms