Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CsprsQ99388 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CsprsQ99388 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CsprsQ99388 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CsprsQ99388 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CsprsQ99388 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CsprsQ99388 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CsprsQ99388 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CsprsQ99388 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CsprsQ99388 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CsprsQ99388 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CsprsQ99388 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CsprsQ99388 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CsprsQ99388 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms